州民政局设5个内设机构：
（一）办公室
起草我州民政事业发展规划和综合性文件、民政工作法规和行政规章；办理行政复议工作；承担机关日常工作。承担局机关公务员和下属事业单位工作人员的考核、调配、奖惩工作；承担人事、信访、电子政务工作；承担民政事业数据统计、机关财务、后勤管理工作。
（二）救灾救济科
承担救灾工作和社会救济政策的监督实施；组织、协调减灾、查灾、慰问灾民等社会救助工作，分配救灾款物并监督、检查使用情况；指导救灾捐赠活动；组织落实救灾项目。承担孤残儿童等特殊群体权益保障政策落实并指导实施；监督实施社会福利事业发展规划和各类福利机构标准及管理规划；指导养老服务体系建设和管理。
（三）优抚安置科
指导组织协调全州拥军优属、拥政爱民和军警民共建工作；督促检查双拥工作和政策、措施的贯彻落实；监督落实各类优抚政策、规定、办法；拟定退伍义务兵、转业士官、复员干部、移交地方安置的军队离退休干部和军队无军籍退休、退职职工安置计划及实施；承担州直单位退役士兵的就业安置；指导军供保障；办理国家机关工作人员因公牺牲审批。
（四）社会事务科
研究提出加强和巩固基层政权建设的意见和建议，指导乡镇政务公开、村务公开、村（居）民委员会民主选举、民主决策、民主管理和民主监督工作；拟定社区服务管理办法及相关政策。 拟定行政区划规划；承办行政区域的设立、撤销、调整、更名和界线变更及政府驻地迁移的审查报批；承担省、州、县际边界勘定管理和承担边界争议的调处；承担全州地名的设置、管理和州内地名普查工作，承办地名管理的有关事宜。指导收养工作和婚姻登记管理工作。
6个下属事业单位：海西州社会救助局、海西州社会组织管理局（参公）、海西州救灾物资储备中心、海西州救助管理站、海西州殡葬管理所、海西州柯柯军供站。
